Program Studi (Prodi) Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Medan dibuka pada tahun 1998. Prodi Biologi diselenggarakan dengan SK penyelenggaraan pada bulan April 1998 dan SK Izin Operasional No. 123/DIKTI/Kep/2007. Program Studi Biologi berada di bawah Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Medan. Program Studi Biologi dipimpin oleh seorang Ketua Prodi yang berasal dari kalangan Dosen dan diangkat berdasarkan SK Rektor. Adapun urutan Ketua Program Studi Biologi adalah Dr. Martina Restuati, M.Si, Dr. Ashar Hasairin, Dra. Rosita Tarigan, M.Pd, Dr. Melva Silitonga, MS dan saat ini diketuai oleh Ahmad Shafwan S. Pulungan, S.Pd., M.Si.
Pada tahun 2020, berdasarkan Keputusan BAN-PT No. 4133/SK/BAN-PT/Akred/S/VII/2020, Program Studi Biologi Terakreditasi A yang berlaku sejak tanggal 21 – Juli – 2020 sampai dengan 21 – Juli 2025.